Χτίστηκε πριν από το 1280 μ.Χ. Βρισκόταν στη συνοικία της Αγίας Τριάδας, στο μεγάλο ακάλυπτο χώρο που υπάρχει σήμερα εκεί. Ένας φαρδύς καλοχτισμένος τοίχος που σώζεται σε ύψος όχι μεγαλύτερο από 60 εκ. μερικές πέτρες σκόρπιες από δω κι από εκεί κι ένας ολόκληρος τοίχος, ο οποίος στην εσωτερική του πλευρά έχει ένα παράθυρο, αποτελούν τα μοναδικά απομεινάρια της εκκλησίας του Αγίου Ιωάννη του Γέρακα.
Πριν από μερικά χρόνια, η εκκλησία σωζόταν ολόκληρη. Κατεδαφίστηκε το 1995 με την επίγνωση ότι πρόκειται για ένα ιστορικό ναό του Χάνδακα.